Os membros da Plenária estão dividios em cinco sub-comissões, cada uma com a sua área de responsabilidade. Segue a lista das diferentes sub-comissões, bem como dos seus membros:
Esta sub-comissão, estuda metodologias e métodos de supervisão e fiscalização do processo de registo de eleitores e da certificação dos cadernos eleitorais pela CNE. Também elabora propostas de planos de supervisão e fiscalização do registo eleitoral e da certificação dos cadernos eleitorais. Uma vez aprovados os planos, cabe à sub-comissão coordenar a sua implementação.
Maria Angelina Lopes Sarmento (Coordenadora) and Silvestre Xavier Sufa
Esta sub-comissão estuda estratégicas e metodologias para implementar os planos de Educação Cívica no país. Desenvolve também os planos operacionais (depois de serem aprovados pela Plenária) e coordena a sua implementação. Também planifica e coordena as campanhas de Educação Cívica e coordenada com outras organizações actividades ligadas a este tema.
Pe. Martinho Germano da Silva Gusmão (Coordenador), Sérgio J. F. Da Costa Hornai and Joana Maria Dulce Vitor
Estuda e promove o desenvolvimento da legislação eleitoral. Prepara pareceres, projectos de regulamentos de competência da CNE, bem como, opiniões da CNE sobre projectos de leis e regulamentos de outros órgãos do estado com relevância eleitoral que tenham sido solicitados pela plenária, o Presidente ou grupo de trabalho. Estuda estratégicas para a adivulgação da legislação eleitoral entre os intervenientes chaves do processo eleitoral.
Tomé Xavier Jerónimo (Coordenador), Deolindo dos Santos and Vicente Fernandes e Brito
Esta sub-comissão garante uma comunicação eficaz entre a CNE e os partidos políticos. Desenvolve um plano de actividades de ligação entre estas duas entidades e assegura uma comunicação permanente e cordial entre os dois. Está também responsável por fazer a ponte entre os pedidos dos partidos políticos e a própria CNE. Além disso recebe, analisa e apresenta para apreciação da Plenária as coligações partidárias para fins eleitorais. Outra das suas funções é a de desenvolver metodologias para distribuir e monitorizar os fundos da subvenção pública para os partidos políticos com representação parlamentar. Por último, coordena a fiscalização e prestação de contas dos partidos ao abrigo da lei da subvenção pública.
José Agostinho da Costa Belo (Coordenador), Maria Teresinha Noronha Cardoso and Alcino de Araújo Baris
Esta sub-comissão é responsável por estabelecer uma boa comunicação e relacionamento entre a CNE e os diferentes intervenientes do processo eleitoral, tais como STAE, Supremo Tribunal de Justiça, Parlamento, organizações da Sociedade civil e público em geral. Também tem de desenvolver estratégias de comunicação com os media e monitorizar o comportamento das publicações jornalísticas que estejam relacionadas com a CNE. Garante ainda uma comunicação efectiva entre a CNE e Observadores Internacionais e Nacionais sobre o processo eleitoral.
Lucas de Sousa (Coordenador), Arif Abdullah Sagran and Manoela Leong Pereira